RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRP2O60462 931 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 ULK1O75385 1050 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNDBP1O95273 360 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEK2P51955 445 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR1D5P58170 312 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLF10Q13118 480 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPESP1Q6UW49 350 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADCK2Q7Z695 626 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPM1MQ96MI6 270 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELOVL6Q9H5J4 265 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX6Q9UNH7 406 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 H0YIV9 168 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT6AP02538 564 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT6BP04259 564 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF883P0CG24 379 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPZBP47756 277 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT6CP48668 564 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSNK1G2P78368 415 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAGE2BQ5JRK9 111 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 NKAIN2Q5VXU1 208 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRG2Q64ET8 278 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADNP2Q6IQ32 1131 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARMC6Q6NXE6 501 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL35Q6PF15 583 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHSY3Q70JA7 882 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4K1Q8NGD4 311 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRG2BQ96QU4 278 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 AKTIPQ9H8T0 292 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 RXFP3Q9NSD7 469 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDYNP01213 254 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPN4P29074 926 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPA2P48052 419 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 EPHA4P54764 986 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAPTM5Q13571 262 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 MED27Q6P2C8 311 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR20Q8TBZ3 569 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 SELENOMQ8WWX9 145 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP7Q93009 1102 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC74AQ96AQ1 378 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 FEZF1A0PJY2 475 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPED1A4D0V7 1026 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP73A6NFT4 308 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBDO15205 165 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIA3P42263 894 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 LSSP48449 732 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNJ2P63252 427 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 GUSBP11Q6P575 273 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF175Q8N4F7 328 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR7G3Q8NG95 312 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 AIF1LQ9BQI0 150 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCG4Q9H172 646 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEMA4GQ9NTN9 838 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 EVA1BQ9NVM1 165 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCNAP12004 261 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 NBL1P41271 181 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR3P46089 330 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 NR1D2Q14995 579 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAA25Q14CX7 972 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC5A12Q1EHB4 618 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLD3Q8IV08 490 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2T11Q8NH01 316 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBGCP3Q96CW5 907 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 PFDN4Q9NQP4 134 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM184CQ9NVA4 438 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCDNQ9UBB6 729 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 POMT2Q9UKY4 750 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CASC3O15234 703 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A2O15244 555 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 B4GAT1O43505 415 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS4BO75351 444 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMNAP02545 664 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 NQO1P15559 274 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGP20916 626 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 REEP5Q00765 189 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRGCQ6NXR0 463 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 RINLQ6ZS11 566 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAS2Q8IYD9 372 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT78Q8N1N4 520 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 POU5F2Q8N7G0 328 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 CMTM5Q96DZ9 223 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10-202ENST00000380221 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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