RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 CDRT15L2A8MXV6 281 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 VARSP26640 1264 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 FRMPD2BQ6IN97 320 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ULBP3Q9BZM4 244 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 IPPKQ9H8X2 491 aa24.75■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 H0YGG7 62 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 OR1F1O43749 312 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SCRG1O75711 98 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SUPT7LO94864 414 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 RPS17P08708 135 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 IMPDH1P20839 514 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 REEP5Q00765 189 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CHIT1Q13231 466 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PAGE2BQ5JRK9 111 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 KRT78Q8N1N4 520 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 GATA6Q92908 595 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 THAP11Q96EK4 314 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TMEM237Q96Q45 408 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 EFCAB11Q9BUY7 163 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.74■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 EPORP19235 508 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 FOXK2Q01167 660 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 LAPTM5Q13571 262 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 DOC2AQ14183 400 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF678Q5SXM1 525 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 OR4N4Q8N0Y3 316 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 OR2A5Q96R48 311 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ACTR8Q9H981 624 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa24.73■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TM9SF1O15321 606 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CD82P27701 267 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 BCL6P41182 706 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CCNG1P51959 295 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TBCCQ15814 346 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 RBBP7Q16576 425 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CSNK1A1LQ8N752 337 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 MFSD9Q8NBP5 474 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TLCD1Q96CP7 247 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 L3HYPDHQ96EM0 354 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 NLNQ9BYT8 704 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 OXSMQ9NWU1 459 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SDK2Q58EX2 2172 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa24.72■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TXNDC9O14530 226 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0754O94854 1291 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZWINTO95229 277 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TIAF1O95411 115 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ASPHQ12797 758 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 GRM7Q14831 915 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 CFAP157Q5JU67 520 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 MDM1Q8TC05 714 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 WDR34Q96EX3 536 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 NDC1Q9BTX1 674 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SARGQ9BW04 601 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 SPNS1Q9H2V7 528 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF749O43361 778 aa24.71■■□□□ 1.55
GKAP1-202ENST00000376365 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms