RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 FBXO30Q8TB52 745 aa21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 PPP1R14BQ96C90 147 aa21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 SGK2Q9HBY8 427 aa21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 USE1Q9NZ43 259 aa21.84■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 CRHBPP24387 322 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 MAPK9P45984 424 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ERVK-21P61565 698 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 PPP2R2BQ00005 443 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 BROXQ5VW32 411 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ATG9BQ674R7 924 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 SYT12Q8IV01 421 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ZNF547Q8IVP9 402 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 TBC1D15Q8TC07 691 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ZNF480Q8WV37 535 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ING2Q9H160 280 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 TOR3AQ9H497 397 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 MAGEB17A8MXT2 336 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 CXCR6O00574 342 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 SCELO95171 688 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ETHE1O95571 254 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 INHBBP09529 407 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 FCARP24071 287 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 IL12RB1P42701 662 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 DPTQ07507 201 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 XAF1Q6GPH4 301 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 MICU2Q8IYU8 434 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 SVOPLQ8N434 492 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 OR7A2PQ8NGA2 310 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 NEIL2Q969S2 332 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 DYRK4Q9NR20 520 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 FAM118AQ9NWS6 357 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.83■■□□□ 1.09
LDB1-201ENST00000361198 MYO9BQ13459 2157 aa21.83■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ABCB7O75027 752 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SH3BGRLO75368 114 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PAPLNO95428 1278 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PRPS1L1P21108 318 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MATN1P21941 496 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 KIR3DL1P43629 444 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GZMMP51124 257 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PCDH1Q08174 1060 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 UGT8Q16880 541 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CALHM3Q86XJ0 350 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 EGFL6Q8IUX8 553 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SDCCAG3Q96C92 435 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PCM1Q15154 2024 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RFXANKO14593 260 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CST1P01037 141 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RETP07949 1114 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PCSK2P16519 638 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MTAPQ13126 283 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 Q6ZNX1 250 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 OR7G3Q8NG95 312 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SUSD6Q92537 303 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 HCN2Q9UL51 889 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.82■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CD247P20963 164 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 OPRD1P41143 372 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TBPL1P62380 186 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ACSM2AQ08AH3 577 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SLC14A1Q13336 389 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TMED1Q13445 227 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ACSM2BQ68CK6 577 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FAM162AQ96A26 154 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MBOAT4Q96T53 435 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FANCEQ9HB96 536 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 COL4A3Q01955 1670 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C1QCP02747 245 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 EPHX1P07099 455 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 P2RY2P41231 377 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 IST1P53990 364 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NFATC3Q12968 1075 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms