RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 GON4LQ3T8J9 2241 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 J3QRK9 145 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC16A5O15375 505 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SULT1C4O75897 302 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJB5O75953 348 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 POP4O95707 220 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 C1QCP02747 245 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGAMP11215 1152 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SP140Q13342 867 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL8Q96CD0 374 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MRGPRX3Q96LB0 322 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FUNDC2Q9BWH2 189 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 OCM2P0CE71 109 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PCMT1P22061 227 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR3DL1P43629 444 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPC1P48995 793 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT18Q6P9A2 607 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM74Q86UV6 250 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PGBD3Q8N328 593 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH12Q9NPG4 1184 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO10Q9UK96 956 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PRPS1L1P21108 318 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PHEXP78562 749 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK5R2Q13319 367 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP4Z1Q86W10 505 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR65Q8IYL9 337 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF566Q969W8 418 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC138Q96M89 665 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM202A6NGA9 273 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 EVPLLA8MZ36 301 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC159P0C7I6 412 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 JUPP14923 745 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ITIH1P19827 911 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ITPKAP23677 461 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 DGKGP49619 791 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD7P51665 324 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 AP1S2P56377 157 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PFN3P60673 137 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTM4Q03013 218 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNC4Q03721 635 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 AQP6Q13520 282 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NELL1Q92832 810 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NODALQ96S42 347 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PBX4Q9BYU1 374 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 EXD2Q9NVH0 621 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FUOMA2VDF0 154 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BCKDKO14874 412 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SCN2BO60939 215 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 MITFO75030 526 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP2A7P20853 494 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR1BP28222 390 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 WASP42768 502 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CHIT1Q13231 466 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 RAPSNQ13702 412 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NR1D2Q14995 579 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CRTC3Q6UUV7 619 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF175Q8N4F7 328 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 MCOLN3Q8TDD5 553 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF13Q92913 245 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCG2Q9UNQ0 655 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 M0QX08 132 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01565O15544 149 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF682O95780 498 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FUCA1P04066 466 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 HALP42357 657 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT3P56703 355 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SPCS2Q15005 226 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT8Q16880 541 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP68Q76N32 757 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms