RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SHISA5Q8N114 240 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 APOPT1Q96IL0 206 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM237Q96Q45 408 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 CCDC189A1A4V9 331 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 CCR10P46092 362 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 CHIT1Q13231 466 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GTF2H2Q13888 395 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 LCA5Q86VQ0 697 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 WDR70Q9NW82 654 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 MYZAPP0CAP1 466 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 EPB42P16452 691 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 GCGRP47871 477 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 CYP4F2P78329 520 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 RNF175Q8N4F7 328 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 IPPKQ9H8X2 491 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.68□□□□□ -1.02
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PDE4D-201ENST00000309641 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 DKK4Q9UBT3 224 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF225Q9UK10 706 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-201ENST00000309641 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.68□□□□□ -1.02
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