RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 PRKCZQ05513 592 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 P3H2Q8IVL5 708 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ELMOD1Q8N336 334 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 POC5Q8NA72 575 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SIAEQ9HAT2 523 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 RAD18Q9NS91 495 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 RLIMQ9NVW2 624 aa16.75■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DSCR3O14972 297 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 C9P02748 559 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GALTP07902 379 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CYP4F2P78329 520 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 KCNJ10P78508 379 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CHIT1Q13231 466 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TIGD6Q17RP2 521 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 UTS2BQ765I0 119 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 OR52J3Q8NH60 311 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TPT1P8Q9HAU6 139 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 RFPL2O75678 378 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DLGAP3O95886 979 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ACPPP15309 386 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 NSG1P42857 185 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SLC6A12P48065 614 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC66Q68CR7 880 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SCAIQ8N9R8 606 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FEVQ99581 238 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 RUBCNLQ9H714 662 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GPR83Q9NYM4 423 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SLC6A14Q9UN76 642 aa16.74■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TET1Q8NFU7 2136 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 AGAP5A6NIR3 686 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DNTTP04053 509 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PRPS1L1P21108 318 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 MAPK1P28482 360 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TRPC1P48995 793 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GAB1Q13480 694 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 STARD8Q92502 1023 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 OR51E2Q9H255 320 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CD84Q9UIB8 345 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FZD4Q9ULV1 537 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 E9PQ18 207 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 H7C4K7 107 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PRPH2P23942 346 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CTSKP43235 329 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 NKX3-2P78367 333 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 BCL2A1Q16548 175 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PGBD3Q8N328 593 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GGHQ92820 318 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 COPS8Q99627 209 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 RRAGCQ9HB90 399 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.73■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 TLL1O43897 1013 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF15O94989 841 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 OR1E2P47887 323 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ACLYP53396 1101 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SMARCB1Q12824 385 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GPR33Q49SQ1 333 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ASB11Q8WXH4 323 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ELMO1Q92556 727 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 FOXJ1Q92949 421 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GFRA2O00451 464 aa16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PDE4A-201ENST00000293683 ETHE1O95571 254 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms