RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIK3CBP42338 1070 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCL23P55773 120 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL17CQ9P0M4 197 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 J3KTA2 159 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF4O60810 478 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 STK16O75716 305 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHOCP08134 193 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAPKAPK2P49137 400 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLDN8P56748 225 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 LINC00299Q6ZSB3 139 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARL15Q9NXU5 204 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MED26O95402 600 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 DMC1Q14565 340 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 OARD1Q9Y530 152 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM227AF5H4B4 570 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 FHP07954 510 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGS6P49758 472 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLAMF1Q13291 335 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELMOD1Q8N336 334 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA17Q96L03 361 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 H3BNC9 293 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 WWP2O00308 870 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLDN9O95484 217 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLKB1P03952 638 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIR3DL1P43629 444 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLCN4P51793 760 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARF5P84085 180 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELP6Q0PNE2 266 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 DUSP4Q13115 394 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIGARQ9NQ88 270 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHCGQ9UBD6 479 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOTOA8MTQ0 251 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEPT4O43236 478 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLDN7O95471 211 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD160O95971 181 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDK1P06493 297 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAMP1P11279 417 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CA8P35219 290 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT2B15P54855 530 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CACNG1Q06432 222 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 SREBF2Q12772 1141 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAMK2BQ13554 666 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP19Q96LK0 163 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK1G2-201ENST00000255641 NINQ8N4C6 2090 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CKMT1AP12532 417 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPN2P17706 415 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 POU1F1P28069 291 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXC8P31273 242 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTR3AP46098 478 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDH12P55289 794 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUBA1BP68363 451 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 MXD1Q05195 221 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 UGT8Q16880 541 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAHD1Q6P587 224 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 LYPD8Q6UX82 237 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms