RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 GPLD1P80108 840 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A3Q00325 362 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SQLEQ14534 574 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 FAM219BQ5XKK7 198 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SYVN1Q86TM6 617 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SNX32Q86XE0 403 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 DLG3Q92796 817 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 MARK4Q96L34 752 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 KCNA7Q96RP8 456 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 THTPAQ9BU02 230 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 TUBB1Q9H4B7 451 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXC6-201ENST00000243108 BAHCC1Q9P281 2608 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 A0A088AWK7 358 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CFAP99D6REC4 459 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PIP5K1BO14986 540 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SGTAO43765 313 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PRB1P04280 392 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 UROSP10746 265 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 AKT1P31749 480 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SLC19A1P41440 591 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CTSCP53634 463 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CUL3Q13618 768 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CDKL4Q5MAI5 379 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 BROXQ5VW32 411 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ESAMQ96AP7 390 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TIMM29Q9BSF4 260 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0G2JNG1 304 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TAPBPO15533 448 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ZW10O43264 779 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 VCLP18206 1134 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 UCNP55089 124 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 KIR2DS5Q14953 304 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PHKG1Q16816 387 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PGM2L1Q6PCE3 622 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 OR10G6Q8NH81 332 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 KPNA5O15131 536 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 VPS4BO75351 444 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 GPC4O75487 556 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 MPC1LP0DKB6 136 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 VAC14Q08AM6 782 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 RBBP7Q16576 425 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 DTX1Q86Y01 620 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 BMPERQ8N8U9 685 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 OR5K4A6NMS3 321 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 A8MU76 341 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 K7ENP7 123 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 QSOX1O00391 747 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 DUX1O43812 170 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ENTPD5O75356 428 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ATP6AP2O75787 350 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PRR35P0CG20 571 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 MSH3P20585 1137 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 MAPK9P45984 424 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 CDKL1Q00532 357 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms