RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 C10orf90Q96M02 699 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 NDC1Q9BTX1 674 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 VPS11Q9H270 941 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1GO43497 2377 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-201ENST00000236273 HYKKA2RU49 373 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 UBXN8O00124 270 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K7O14733 419 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RAB40ALP0C0E4 278 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 GLRBP48167 497 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ARSFP54793 590 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NFKB2Q00653 900 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 STARD8Q92502 1023 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 GPR87Q9BY21 358 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CD274Q9NZQ7 290 aa21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 IGSF10Q6WRI0 2623 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CCDC189A1A4V9 331 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 DSCR3O14972 297 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 KLK8O60259 260 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 WDR47O94967 919 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FURINP09958 794 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 EPORP19235 508 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PTPN4P29074 926 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B3P37058 310 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 HSPA7P48741 367 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CCR8P51685 355 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 RPS18P62269 152 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 DCDP81605 110 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FAM69BQ5VUD6 431 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TAOK1Q7L7X3 1001 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NLNQ9BYT8 704 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 KCND3Q9UK17 655 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GX78 115 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 KATNA1O75449 491 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 STATHP02808 62 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ALAS2P22557 587 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 AGTR2P50052 363 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 EMP3P54852 163 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 FAM214AQ32MH5 1076 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TECRLQ5HYJ1 363 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PCSK4Q6UW60 755 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 COX15Q7KZN9 410 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MFSD9Q8NBP5 474 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 EXT2Q93063 718 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 THAP11Q96EK4 314 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CD244Q9BZW8 370 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ACTL8Q9H568 366 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 PELI2Q9HAT8 420 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 WWOXQ9NZC7 414 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.25■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CREG1O75629 220 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 STK16O75716 305 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 SBK3P0C264 359 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 COL6A2P12110 1019 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 LGSNQ5TDP6 509 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 CYP4X1Q8N118 509 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 UBTD2Q8WUN7 234 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 TTC9Q92623 222 aa21.24■□□□□ 0.99
SYF2-201ENST00000236273 MTBPQ96DY7 904 aa21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms