RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 ASB11Q8WXH4 323 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNDC15Q96J42 360 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CHST8Q9H2A9 424 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf78A6NCI8 922 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 LATS1O95835 1130 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 GSTT2BP0CG30 244 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 B4GALNT1Q00973 533 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 USP43Q70EL4 1123 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 LYSMD1Q96S90 227 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 EBPLQ9BY08 206 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 JUPP14923 745 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 HIST1H2ADP20671 130 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYBA2P53672 197 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF33BQ06732 778 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM124AQ86V42 546 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.42■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 GGT2P36268 569 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC13A2Q13183 592 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 RETSATQ6NUM9 610 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa21.41■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 COPS8Q99627 209 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP44Q9C0F1 390 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC11Q9NVH1 559 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 RFPL2O75678 378 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 MPC1LP0DKB6 136 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 COX7A2P14406 83 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 GADD45AP24522 165 aa21.41■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC22Q8N4W6 341 aa21.41■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 TPT1P8Q9HAU6 139 aa21.41■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.41■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC19A1P41440 591 aa21.4■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 TIGD6Q17RP2 521 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 COLEC12Q5KU26 742 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 DEPDC1Q5TB30 811 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 STEAP3Q658P3 488 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 APCDD1Q8J025 514 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TPD52L3Q96J77 140 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCG8Q9H221 673 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM229AB2RXF0 380 aa21.4■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 FLT3LGP49771 235 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH18Q13634 790 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR153Q6NV75 609 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PNCKQ6P2M8 343 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PAF1Q8N7H5 531 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 GGHQ92820 318 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD9AQ99638 391 aa21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCA1A8K7I4 914 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 A8MX80 341 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC16A5O15375 505 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TEKQ02763 1124 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SP140Q13342 867 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 AMER2Q8N7J2 671 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 PROX1Q92786 737 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CTRCQ99895 268 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 GFYI3L273 518 aa21.39■■□□□ 1.01
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