RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000008440.9

SPRTN-201, Transcript of SprT-like N-terminal domain, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPRTN, Length 1,667 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTN-201ENST00000008440 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.49■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 SEC16AO15027 2179 aa20.49■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 GRK3P35626 688 aa20.48■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 CASP2P42575 452 aa20.48■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 NAA20P61599 178 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 KMT5CQ86Y97 462 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 KCNA7Q96RP8 456 aa20.48■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 FFAR3O14843 346 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 GPR42O15529 346 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 ESRRBO95718 433 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 FOXA1P55317 472 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM114B3SHH9 223 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRTN-201ENST00000008440 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SPRTN-201ENST00000008440 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 CYP4F2P78329 520 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 FOXM1Q08050 763 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 LAPTM5Q13571 262 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRTN-201ENST00000008440 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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