RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 Glod5Q9D8I3 148 aa18.28■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 PigqQ9QYT7 581 aa18.28■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 SptbP15508 2128 aa18.28■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 A630010A05RikA9C473 232 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Serpinb6eI7HJI3 429 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Stmn4P63042 189 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pdp2Q504M2 532 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnajc11Q5U458 559 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Itih1Q61702 907 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mapkap1Q8BKH7 522 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q8C1R3 189 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cog4Q8R1U1 785 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pcdhb10Q91VE5 797 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Alg1Q921Q3 482 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pop7Q9DCH2 140 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Defb5Q9EPV9 64 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cdh22Q9WTP5 813 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Clec2iQ9WVF9 217 aa18.27■□□□□ 0.52
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp407G3UVV3 2246 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Golga4Q91VW5 2238 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ephb6O08644 1014 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfpm1O35615 995 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pld2P97813 933 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cacna1cQ01815 2139 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 RalgdsQ03385 852 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmem248Q3TBN1 314 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lrrc28Q3TX51 367 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atf7ip2Q3UL97 452 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cnga4Q3UW12 575 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Spa17Q62252 149 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Brinp2Q6DFY8 783 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dennd2cQ6P9P8 914 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gpr75Q6X632 540 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp606Q7TSV0 794 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Galnt7Q80VA0 657 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Plekha8Q80W71 519 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Hint3Q9CPS6 165 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Prelid3bQ9CYY7 195 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ppa1Q9D819 289 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ccdc182Q9D9C6 152 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lypd2Q9DD23 127 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tubb3Q9ERD7 450 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 NpvfQ9ESQ8 188 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tgm1Q9JLF6 815 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnajb8Q9QYI7 227 aa18.27■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Igkv15-103A0A140T8P3 115 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr741L7N1Y5 311 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc6a2O55192 617 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 P01637 128 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ripk2P58801 539 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ffar3Q3UFD7 319 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Xrcc1Q60596 631 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tvp23aQ6NVH0 222 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Abhd16bQ80YU0 474 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Casp9Q8C3Q9 454 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 1700001C19RikQ8K168 210 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mmp21Q8K3F2 568 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 TympQ99N42 471 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 HhatlQ9D1G3 503 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr701Q9D3U9 316 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 TesminQ9WTJ6 475 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 ReckQ9Z0J1 971 aa18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm35315A0A1B0GRI2 571 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm2056J3QQ02 144 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Vmn2r46L7N282 809 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 GnazO70443 355 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Surf2P09926 257 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sbk2P0C5K1 362 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Icam1P13597 537 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Uhmk1P97343 419 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 RflnbQ5SVD0 216 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rabl6Q5U3K5 725 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Six3Q62233 333 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tspan7Q62283 249 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mfsd4aQ6PDC8 510 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Megf11Q80T91 1091 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rhox11Q810N8 206 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cxcr1Q810W6 351 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Coq4Q8BGB8 266 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gpr152Q8BXS7 511 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Brinp1Q920P3 760 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Actrt2Q9D9L5 377 aa18.25■□□□□ 0.51
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc28a3Q9ERH8 703 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms