RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sdc3Q64519 442 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 S100a15aQ6S5I3 108 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ItpkcQ7TS72 678 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Banf2Q8BVR0 90 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc22Q8C159 568 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ExogQ8C163 368 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crb3Q8QZT4 113 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Osgin1Q8VC10 478 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clec2fQ8VI21 196 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RabifQ91X96 123 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Moxd1Q9CXI3 613 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ArpinQ9D0A3 226 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dusp21Q9D9D8 189 aa21.78■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap46E9Q2C0 2641 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ighv1-42A0A0A6YY38 117 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5678A0A1B0GRG8 277 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf382B2RXC5 579 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clip3B9EHT4 547 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc9a3G3X939 829 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RoraP51448 523 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6v0d1P51863 351 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc45a4Q0P5V9 785 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aars2Q14CH7 980 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp868Q3UTQ6 422 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AccslQ3UX83 580 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nab1Q61122 486 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TsnQ62348 228 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp4b1Q64462 511 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1197Q7TR13 314 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1196Q7TR14 314 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1512Q8VF72 313 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pdia5Q921X9 517 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc130Q9D516 385 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MrgbpQ9DAT2 204 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nipa2Q9JJC8 359 aa21.77■■□□□ 1.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ahctf1Q8CJF7 2243 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm15091B1AZM2 449 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 L3mbtl4B1B1A0 621 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 2310061I04RikB8JJ69 315 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trove2O08848 538 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hs3st1O35310 311 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chrm4P32211 479 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr143P70259 405 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Padi2Q08642 673 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taok1Q5F2E8 1001 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RflnbQ5SVD0 216 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vsx2Q61412 361 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grm7Q68ED2 915 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Utf1Q6J1H4 339 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr75Q6X632 540 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr32Q7TQZ0 308 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp8Q80U87 1080 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmcc2Q80W04 706 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubap1Q8BH48 502 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Timmdc1Q8BUY5 285 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BtdQ8CIF4 520 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2j9Q924D1 502 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Otud1Q9CUB6 454 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RgccQ9DBX1 137 aa21.76■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13040A2A8C4 496 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcp11x2A2AEI7 503 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spats1A2RRY8 269 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam71e2L7N480 754 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01669 111 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CfpP11680 464 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CblP22682 913 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps15P62843 145 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem248Q3TBN1 314 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp4aQ64436 1033 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gabra5Q8BHJ7 463 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc35c1Q8BLX4 363 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp27Q8CEG8 438 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Txndc9Q9CQ79 226 aa21.75■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmrn1B2RPV6 1210 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nrp2O35375 931 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bmpr2O35607 1038 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pknox1O70477 436 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LcorlQ3U285 600 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skap2Q3UND0 358 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grid1Q61627 1009 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hspa1aQ61696 641 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 OmpQ64288 163 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1051Q7TR76 308 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr798Q7TRH8 311 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Piwil4Q8CGT6 848 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc23Q8CHY7 488 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nudt13Q8JZU0 352 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc16Q8R349 620 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ClyblQ8R4N0 338 aa21.74■■□□□ 1.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc35c2Q8VCX2 364 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.5 ms