RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641005.1

SAMMSON-203, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,168 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-203ENST00000641005 CD244Q9BZW8 370 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 STRADBQ9C0K7 418 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 FGF21Q9NSA1 209 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 BTRCQ9Y297 605 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PLLPQ9Y342 182 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 AK5Q9Y6K8 562 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SYCE1LA8MT33 242 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 H3BMH7 237 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 E2F3O00716 465 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 GLRA3O75311 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 B3GALT4O96024 378 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 NTRK1P04629 796 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 RBP1P09455 135 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 MYZAPP0CAP1 466 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CMPK1P30085 196 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 HSD17B2P37059 387 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 BCL6P41182 706 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PIK3CGP48736 1102 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 HNMTP50135 292 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TGIF1Q15583 401 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 HKDC1Q2TB90 917 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 LCTLQ6UWM7 567 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 C17orf64Q86WR6 236 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ATL1Q8WXF7 558 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 GATA6Q92908 595 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PDE7BQ9NP56 450 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 KALRNO60229 2985 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ATRXP46100 2492 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 WDR91A4D1P6 747 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ZNF839A8K0R7 811 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 H0YGG7 62 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 OR7A17O14581 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SH3BGRLO75368 114 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 KATNA1O75449 491 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SLC5A2P31639 672 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CCT5P48643 541 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CYP4F2P78329 520 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 MC2RQ01718 297 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CDC16Q13042 620 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 DOC2AQ14183 400 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PCLAFQ15004 111 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 UNC50Q53HI1 259 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 HDXQ7Z353 690 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 CCDC63Q8NA47 563 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TLCD1Q96CP7 247 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PGM2Q96G03 612 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SMC6Q96SB8 1091 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 WDR70Q9NW82 654 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 OPTCQ9UBM4 332 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ZNF225Q9UK10 706 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 PCTPQ9UKL6 214 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-203ENST00000641005 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.12□□□□□ -1.27
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