RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	VAPB	O95292	243 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAMEF1	O95521	474 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	NDST3	O95803	873 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ACP5	P13686	325 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	JUND	P17535	347 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CR2	P20023	1033 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	IL10	P22301	178 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HSD17B2	P37059	387 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGA8	P53708	1063 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	GEM	P55040	296 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR85	P60893	370 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A3	Q00325	362 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ELP6	Q0PNE2	266 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB39A	Q14964	217 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-B	Q31612	363 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ESCO2	Q56NI9	601 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	EID2	Q8N6I1	236 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR26	Q8NDV2	337 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TMIE	Q8NEW7	156 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PATE1	Q8WXA2	126 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3R3	Q92569	461 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	EID2B	Q96D98	161 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM80	Q96HE8	168 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf72	Q96LT7	481 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF599	Q96NL3	588 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TSGA13	Q96PP4	275 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CHID1	Q9BWS9	393 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PSME2	Q9UL46	239 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM63A	O94886	807 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT1	P04628	370 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	GSN	P06396	782 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGAV	P06756	1048 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	MPST	P25325	297 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	OXTR	P30559	389 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP8	P85298	464 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PTS	Q03393	145 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SNTA1	Q13424	505 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DNASE1L3	Q13609	305 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ENPP2	Q13822	863 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRNA6	Q15825	494 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKN3	Q16667	212 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PARP8	Q8N3A8	854 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB124	Q8NES8	71 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	HDAC10	Q969S8	669 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SCRN2	Q96FV2	425 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINI1	Q99574	410 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RDH14	Q9HBH5	336 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	SGK2	Q9HBY8	427 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	PAK5	Q9P286	719 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
LETMD1-238	ENST00000623495	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCF5	A8MTL0	148 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HACD1	B0YJ81	288 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINT1	O43278	529 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPINI2	O75830	405 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNK	O75909	580 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK14	O94921	469 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RECK	O95980	971 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29

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