RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PMP22	Q01453	160 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF425	Q6IV72	752 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM205	Q6UW68	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC89	Q8N998	374 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SMPDL3A	Q92484	453 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	LPGAT1	Q92604	370 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MVB12A	Q96EY5	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	OR2A5	Q96R48	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SYBU	Q9NX95	663 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PDZD2	O15018	2839 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MYO1C	O00159	1063 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CCL21	O00585	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	HAT1	O14929	419 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PHF2	O75151	1096 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	VAPB	O95292	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	RASAL1	O95294	804 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	STATH	P02808	62 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ANXA5	P08758	320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MGAT1	P26572	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ATP5D	P30049	168 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CA7	P43166	264 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ICE2	Q659A1	982 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PLD3	Q8IV08	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PKP4	Q99569	1192 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	IL22	Q9GZX6	179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	DRC3	Q9H069	523 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PRAMEF2	O60811	474 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CHRM3	P20309	590 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	HTR1E	P28566	365 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	NPY2R	P49146	381 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	KCNJ11	Q14654	390 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF480	Q8WV37	535 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	SLC30A3	Q99726	388 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	KIFC1	Q9BW19	673 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	BFAR	Q9NZS9	450 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS5-208	ENST00000599909	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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