RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	CYTH2	Q99418	400 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1W2PPV9	198 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	STATH	P02808	62 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CD53	P19397	219 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	AP2B1	P63010	937 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PID1	Q7Z2X4	250 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR2L3	Q8NG85	312 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560		A0A087X0T9	212 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR2A25	A4D2G3	310 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	P2RX6	O15547	441 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FAM228B	P0C875	321 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GLI4	P10075	376 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DCAF7	P61962	342 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	UBE2H	P62256	183 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	WIPF1	O43516	503 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR1I1	O60431	355 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SUN1	O94901	812 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	AP2A2	O94973	939 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CCR7	P32248	378 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ITGA8	P53708	1063 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GPR85	P60893	370 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.37	□□□□□ -0.59	2e-6	■■□□□ 13.1
NUP62-216	ENST00000599560	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ACAD11	Q709F0	780 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.37	□□□□□ -0.59

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