RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 SMPDL3AQ92484 453 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 BIRC8Q96P09 236 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2A5Q96R48 311 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 PAK5Q9P286 719 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 SCN2AQ99250 2005 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5H15A6NDH6 313 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO1CO00159 1063 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL21O00585 134 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF2O60811 474 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 NIPSNAP2O75323 286 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ANXA5P08758 320 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ICAM2P13598 275 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 HTR1EP28566 365 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 EFNA3P52797 238 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF5AQ12840 1032 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT16Q17RD7 645 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 MTFR2Q6P444 385 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RPTNQ6XPR3 784 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 AMER2Q8N7J2 671 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 LPGAT1Q92604 370 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM136AQ96C01 138 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 IL22Q9GZX6 179 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 DRC3Q9H069 523 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 CHST11Q9NPF2 352 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TAC3Q9UHF0 121 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BMM5 538 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNDC9O14530 226 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 P2RX6O15547 441 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNDBP1O95273 360 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 VAPBO95292 243 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ESR1P03372 595 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 CATP04040 527 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 MYBL2P10244 700 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 FMO4P31512 558 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF75DP51815 510 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PNLIPRP1P54315 467 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ADARP55265 1226 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RELAQ04206 551 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RBPJQ06330 500 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF33BQ06732 778 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX1Q13596 522 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM53BQ14153 422 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 ICE2Q659A1 982 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 MFSD3Q96ES6 412 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 KIFC1Q9BW19 673 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 STMN3Q9NZ72 180 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 BFARQ9NZS9 450 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 GALPQ9UBC7 116 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-226ENST00000593200 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms