RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591382.5

EFTUD2-220, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,675 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-220ENST00000591382 NPRL3Q12980 569 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 26.7
EFTUD2-220ENST00000591382 PYDC2Q56P42 97 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CARD16Q5EG05 197 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 DESI1Q6ICB0 168 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 LGI4Q8N135 537 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FEVQ99581 238 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 DYRK4Q9NR20 520 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FAM92AA1XBS5 289 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 M0QX08 132 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 GJA1P17302 382 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 KRT20P35900 424 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 PTPN5P54829 565 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 INAVAQ3KP66 663 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 DUSP26Q9BV47 211 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 NEK6Q9HC98 313 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 IL37Q9NZH6 218 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 OR7A17O14581 309 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZW10O43264 779 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TLL1O43897 1013 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 IGSF6O95976 241 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 NPPAP01160 153 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 NUDT7P0C024 238 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TSPAN19P0C672 248 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 IFI30P13284 250 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 PTNP21246 168 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CD40LGP29965 261 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 VLDLRP98155 873 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 XAF1Q6GPH4 301 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FUT10Q6P4F1 479 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZNF675Q8TD23 568 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TANKQ92844 425 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 UROC1Q96N76 676 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CORO1BQ9BR76 489 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 CLN6Q9NWW5 311 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 MTMR11A4FU01 709 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 RFPL2O75678 378 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TGFB1P01137 390 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 SYN1P17600 705 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 SPAM1P38567 509 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 SLC15A1P46059 708 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 PPP5CP53041 499 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 GRIK2Q13002 908 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 VMACQ2NL98 169 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZNF691Q5VV52 312 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 FRG2Q64ET8 278 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 BEND5Q7L4P6 421 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-220ENST00000591382 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms