RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 DUXAA6NLW8 204 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 MTX2O75431 263 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 SLC15A1P46059 708 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC32Q14392 662 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 PYURFQ96I23 114 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 SLC38A3Q99624 504 aa20.8■□□□□ 0.92
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