RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579916.5

CCDC178-208, Transcript of coiled-coil domain containing 178, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC178, Length 1,017 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC178-208	ENST00000579916	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		H3BNX3	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916		K7ERQ8	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TLR4	O00206	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	YKT6	O15498	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	UGDH	O60701	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CTSL	P07711	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PRLR	P16471	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	RRM1	P23921	792 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SDC4	P31431	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CHRNA3	P32297	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NUDT1	P36639	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	KLK7	P49862	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FOXL2	P58012	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TAS2R38	P59533	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CDR2	Q01850	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	KRT31	Q15323	416 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SHB	Q15464	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CDO1	Q16878	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	KLK6	Q92876	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	MARK4	Q96L34	752 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC178-208	ENST00000579916	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	RNF103	O00237	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	TAF4	O00268	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	EPHB6	O15197	1021 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC31A1	O15431	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	SDC3	O75056	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	NDUFB8	O95169	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	CHRNB2	P17787	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	HNF1B	P35680	557 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	STAT1	P42224	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	THBS3	P49746	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	DNA2	P51530	1060 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	TAS2R50	P59544	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	ARF5	P84085	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	GNA12	Q03113	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	OVGP1	Q12889	678 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	SYCP1	Q15431	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCDC178-208	ENST00000579916	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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