RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	USP7	Q93009	1102 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MED8	Q96G25	268 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PDXP	Q96GD0	296 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	BMF	Q96LC9	184 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WDR92	Q96MX6	357 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR2M4	Q96R27	311 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SGPP1	Q9BX95	441 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ACTR8	Q9H981	624 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	EBF2	Q9HAK2	575 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FGF22	Q9HCT0	170 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KL	Q9UEF7	1012 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KCNK6	Q9Y257	313 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ASF1A	Q9Y294	204 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		B2RBV5	119 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		E7EQ34	232 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		H0YHG0	523 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC28A1	O00337	649 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FFAR3	O14843	346 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GYG2	O15488	501 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GPR42	O15529	346 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF4	O60810	478 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PEX11A	O75192	247 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KRT6A	P02538	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KRT6B	P04259	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	THRA	P10827	490 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IDO1	P14902	403 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	JUP	P14923	745 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CD1E	P15812	388 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CD22	P20273	847 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GPX3	P22352	226 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HTR1B	P28222	390 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CPOX	P36551	454 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NUDT1	P36639	197 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CASP2	P42575	452 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RABIF	P47224	123 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KRT6C	P48668	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ACADVL	P49748	655 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CLCNKA	P51800	687 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PNLIPRP1	P54315	467 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ERVK-8	P63133	956 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CUL3	Q13618	768 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	E2F2	Q14209	437 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NR6A1	Q15406	480 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MAPRE2	Q15555	327 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CYP2A13	Q16696	494 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LIPJ	Q5W064	366 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZSR9	355 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SNX32	Q86XE0	403 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MIER2	Q8N344	545 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NXPE2	Q96DL1	559 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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