RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ADALQ6DHV7 355 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GLRX5Q86SX6 157 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM58Q8NG06 486 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SNAPC3Q92966 411 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SMARCE1Q969G3 411 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ERGIC1Q969X5 290 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 OR1F2PQ96R84 312 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SDF4Q9BRK5 362 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PARD6BQ9BYG5 372 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF302Q9NR11 478 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HES2Q9Y543 173 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 LRBAP50851 2863 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NF1P21359 2839 aa4.77□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
ATXN3-218ENST00000553309 NEDD4P46934 1319 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 H0YC42 278 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NDUFAB1O14561 156 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF197O14709 1029 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GUCY1B2O75343 617 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE7O76087 117 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NDUFB4O95168 129 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PRAMEF12O95522 483 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 STAMBPO95630 424 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE12FP0CL80 117 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE12GP0CL81 117 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE12IP0CL82 117 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HSD3B1P14060 373 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 P2RY2P41231 377 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CASP2P42575 452 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SLC26A2P50443 739 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CDH15P55291 814 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ARPP19P56211 112 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 UBASH3AP57075 661 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SNX16P57768 344 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GRIK2Q13002 908 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE1Q13065 139 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GAGE4Q13068 117 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SNTA1Q13424 505 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 VEPH1Q14D04 833 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 IGFBP7Q16270 282 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TAF12Q16514 161 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CALCRLQ16602 461 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 UBE2SQ16763 222 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SLC22A25Q6T423 547 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ERICH1Q86X53 443 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 FGF11Q92914 225 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SPDL1Q96EA4 605 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ELP4Q96EB1 424 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CFAP36Q96G28 342 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 C1orf74Q96LT6 269 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NUF2Q9BZD4 464 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZWILCHQ9H900 591 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PARVGQ9HBI0 331 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HSF4Q9ULV5 492 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 DOCK7Q96N67 2140 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NID2Q14112 1375 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms