RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222		Q0VFX4	171 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GBX1	Q14549	363 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TMED2	Q15363	201 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RPE65	Q16518	533 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SYTL3	Q4VX76	610 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RELT	Q969Z4	430 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NDN	Q99608	321 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TLCD2	A6NGC4	264 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CCL21	O00585	134 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	VPS26A	O75436	327 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ALPP	P05187	535 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TUBB	P07437	444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ACADL	P28330	430 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CDKN2D	P55273	166 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	VWA2	Q5GFL6	755 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NRGN	Q92686	78 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GBP5	Q96PP8	586 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GPR21	Q99679	349 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	RBBP8	Q99708	897 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNF749	O43361	778 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FAM155B	O75949	473 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	UMOD	P07911	640 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FDXR	P22570	491 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ATP5D	P30049	168 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SLC29A2	Q14542	456 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OLFM1	Q99784	485 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	F10	P00742	488 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	CYP2A7	P20853	494 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CS-231	ENST00000552222	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29

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