RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GLULP15104 373 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAKP20794 623 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRRX1P54821 245 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GNA12Q03113 381 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MTF1Q14872 753 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DDR2Q16832 855 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL22Q53GT1 634 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FJX1Q86VR8 437 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SKA3Q8IX90 412 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A3Q99624 504 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PLOD2O00469 737 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RGS14O43566 566 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC28A2O43868 658 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 H6PDO95479 791 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HOXB2P14652 356 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GNAZP19086 355 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 COMTP21964 271 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TGFBR2P37173 567 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CPA2P48052 419 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CREB5Q02930 508 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GRIN2CQ14957 1233 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IFI44LQ53G44 452 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DOK6Q6PKX4 331 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DSELQ8IZU8 1212 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NAGSQ8N159 534 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TC2NQ8N9U0 490 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SEC14L1Q92503 715 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HYLS1Q96M11 299 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDC6Q99741 560 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UCK2Q9BZX2 261 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 USP29Q9HBJ7 922 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NUDT15Q9NV35 164 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UPB1Q9UBR1 384 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PROM1O43490 865 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP3O75969 853 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 EDNRBP24530 442 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TIE1P35590 1138 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CCNJQ5T5M9 372 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LPCAT4Q643R3 524 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 USP53Q70EK8 1073 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CADM3Q8N126 398 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR10A4Q9H209 315 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GDF3Q9NR23 364 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BTAF1O14981 1849 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf51A6NDU8 294 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR5K4A6NMS3 321 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A1O15245 554 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TM7SF2O76062 418 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CBX6O95503 412 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CER1O95813 267 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CA3P07451 260 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CCNOP22674 350 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 S100GP29377 79 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NTSP30990 170 aa6.15□□□□□ -1.43
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