RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CD200R1Q8TD46 325 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL21AQ8WXB1 218 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF592Q92610 1267 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PMEPA1Q969W9 287 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM136AQ96C01 138 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MIEF2Q96C03 454 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LINGO1Q96FE5 620 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PKP4Q99569 1192 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 EGFL8Q99944 293 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPKQ9BS16 269 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DRC3Q9H069 523 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RHOJQ9H4E5 214 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GPAMQ9HCL2 828 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 C5AR2Q9P296 337 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TAC3Q9UHF0 121 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TEKT2Q9UIF3 430 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC23Q9UJX2 597 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX24Q9Y343 169 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 NFS1Q9Y697 457 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MED13Q9UHV7 2174 aa5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0J9YVX5 310 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2A25A4D2G3 310 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 USP27XA6NNY8 438 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AGPSO00116 658 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP2K7O14733 419 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SUV39H1O43463 412 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HEXBP07686 556 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ERGP11308 486 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF28P17035 718 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GNAZP19086 355 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SAT1P21673 171 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 JAK1P23458 1154 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 IVDP26440 423 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CRABP2P29373 138 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 OTX2P32243 289 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GP5P40197 560 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CASRP41180 1078 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL11P51671 97 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PLTPP55058 493 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V0D1P61421 351 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4F2P78329 520 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MPP1Q00013 466 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CBLBQ13191 982 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PWP1Q13610 501 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CUL1Q13616 776 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DSG2Q14126 1118 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CSHL1Q14406 222 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLMAPQ14BN4 828 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RBBP7Q16576 425 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB110Q30KQ9 67 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00303Q3SY05 128 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf189Q5VU69 101 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RAPH1Q70E73 1250 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF44Q7L0R7 432 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC25Q86WR0 208 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP112Q8N8E3 955 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPV3Q8NET8 790 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF480Q8WV37 535 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms