RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543882.5

TM7SF3-215, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 5

Gene TM7SF3, Length 762 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-215ENST00000543882 PARVBQ9HBI1 364 aa7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.5□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TARM1B6A8C7 271 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 C21orf140B9A014 251 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 H0YGG7 62 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 H7BY64 318 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 SLC16A5O15375 505 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 P2RX6O15547 441 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 DNAJB5O75953 348 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 FKBP9O95302 570 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ITGB2P05107 769 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ALAS2P22557 587 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 PTPN4P29074 926 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 GP5P40197 560 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 GSK3AP49840 483 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CHAF1BQ13112 559 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 BMPR2Q13873 1038 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NCF4Q15080 339 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 HKDC1Q2TB90 917 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MLIPQ5VWP3 458 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CPZQ66K79 652 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 COX15Q7KZN9 410 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ADCK2Q7Z695 626 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 SHISA5Q8N114 240 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MNS1Q8NEH6 495 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 IFT81Q8WYA0 676 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CDKL2Q92772 493 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 PTERQ96BW5 349 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 C10orf90Q96M02 699 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CCDC138Q96M89 665 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 OR4K3Q96R72 315 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CPNE1Q99829 537 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NDC1Q9BTX1 674 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 SGPP1Q9BX95 441 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 GPAMQ9HCL2 828 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CUTCQ9NTM9 273 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ARL15Q9NXU5 204 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 KCND3Q9UK17 655 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TCFL5Q9UL49 500 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CACNA1GO43497 2377 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 A0A1B0GX78 115 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 FEZF1A0PJY2 475 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 HMX2A2RU54 273 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 FITM1A5D6W6 292 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF839A8K0R7 811 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 K7EM74 188 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MASP2O00187 686 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 FFAR3O14843 346 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 DSCR3O14972 297 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 GPR42O15529 346 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 MAN1A2O60476 641 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CCNDBP1O95273 360 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 ACSL3O95573 720 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 TUBB4AP04350 444 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 HBQ1P09105 142 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 GSTA2P09210 222 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CCDC166P0CW27 439 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 CDH1P12830 882 aa7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TM7SF3-215ENST00000543882 NR1D1P20393 614 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms