RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 PARP10Q53GL7 1025 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 C12orf60Q5U649 245 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 FRG2Q64ET8 278 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 TTC27Q6P3X3 843 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 BEST3Q8N1M1 668 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 LRRC43Q8N309 656 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 PGBD5Q8N414 524 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 SLC35C1Q96A29 364 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 EGLN2Q96KS0 407 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 C6orf50Q9HD87 102 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.89□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 UBE4BO95155 1302 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 COL4A1P02462 1669 aa4.89□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 PRSS44E7EML9 344 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 M0QZ24 198 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 P4HA2O15460 535 aa4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 SMIM24O75264 130 aa4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 EGFP01133 1207 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H2ABP04908 130 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 ACTN1P12814 892 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 SRCP12931 536 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 CYP11B2P19099 503 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 HIST1H2ADP20671 130 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 RRM1P23921 792 aa4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 XIAPP98170 497 aa4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 SNX1Q13596 522 aa4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 XKR9Q5GH70 373 aa4.88□□□□□ -1.63
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TRDN-204ENST00000542443 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.88□□□□□ -1.63
TRDN-204ENST00000542443 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.88□□□□□ -1.63
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