RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541134.5

HIVEP1-208, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HIVEP1-208	ENST00000541134	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	FZD4	Q9ULV1	537 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134		H0YC42	278 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	STC1	P52823	247 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RAB8B	Q92930	207 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	C6orf47	O95873	294 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SRY	Q05066	204 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NOBOX	O60393	691 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	MFN2	O95140	757 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	UNC5C	O95185	931 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	GADD45G	O95257	159 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	ANPEP	P15144	967 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PROZ	P22891	400 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		11.5	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	MANBA	O00462	879 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	C9	P02748	559 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RING1	Q06587	406 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	STRA6	Q9BX79	667 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CD47	Q08722	323 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TCEA3	O75764	348 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	ACRV1	P26436	265 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TMEM240	Q5SV17	173 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	BCL10	O95999	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RANBP1	P43487	201 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CXCR6	O00574	342 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	OR4D2	P58180	307 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	DSC1	Q08554	894 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RBBP4	Q09028	425 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	DLX3	O60479	287 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	UFM1	P61960	85 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	BPI	P17213	487 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57	7e-7	■■■■□ 24.2
HIVEP1-208	ENST00000541134	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	LRP8	Q14114	963 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PTPRR	Q15256	657 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TGFBI	Q15582	683 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		11.49	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	IL1RN	P18510	177 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134		Q96MT0	163 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CPNE6	O95741	557 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CRISP3	P54108	245 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.48	□□□□□ -0.57
HIVEP1-208	ENST00000541134	PKP4	Q99569	1192 aa		11.48	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.9 ms