RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265		A0A096LPI6	279 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CLIC1	O00299	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	BMP2	P12643	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ALDH9A1	P49189	494 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CCT8	P50990	548 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	FAM110B	Q8TC76	370 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	OBSL1	O75147	1896 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SOCS2	O14508	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	HSD3B1	P14060	373 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	C5AR1	P21730	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	HSD3B2	P26439	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	GALK1	P51570	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CDK3	Q00526	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	C2orf80	Q0P641	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265		A6NHS1	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	KMO	O15229	486 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PRKD3	O94806	890 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	LAMP2	P13473	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ENG	P17813	658 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PRIM2	P49643	509 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	DPT	Q07507	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	FGF14	Q92915	247 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PPCDC	Q96CD2	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SERPINA1	P01009	418 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	GGT1	P19440	569 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CXCR2	P25025	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF583	Q96ND8	569 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265		A0A1W2PQU0	124 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265		H0YIV9	168 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	LAT	O43561	262 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CREG1	O75629	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	HOXB2	P14652	356 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	CRAT	P43155	626 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ESRRG	P62508	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	SPIDR	Q14159	915 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDX11-208	ENST00000536265	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms