RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	EYS	Q5T1H1	3165 aa		3.9	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	FAM186A	A6NE01	2351 aa		3.9	□□□□□ -1.78
MDM2-223	ENST00000536089	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GPAA1	O43292	621 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PRKAB2	O43741	272 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MED24	O75448	989 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	OAZ2	O95190	189 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	C22orf31	O95567	290 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PMS2P2	O95744	297 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	OR52Z1	P0C646	297 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	LINC00271	P0C7V0	271 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	FCGR1A	P12314	374 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	IL9	P15248	144 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	USP8	P40818	1118 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	NPY4R	P50391	375 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	BMX	P51813	675 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GTF2H2	Q13888	395 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79	1e-7	■■■■□ 26.1
MDM2-223	ENST00000536089	STXBP2	Q15833	593 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	VWC2	Q2TAL6	325 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	IQCA1	Q86XH1	822 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PPTC7	Q8NI37	304 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	NEUROG1	Q92886	237 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MIB2	Q96AX9	1013 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ADGRG7	Q96K78	797 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TTC14	Q96N46	770 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MGME1	Q9BQP7	344 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SPRY4	Q9C004	299 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	STX8	Q9UNK0	236 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ABCB11	O95342	1321 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZMYM6	O95789	1325 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MYO7A	Q13402	2215 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PP11	408 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	LILRA5	A6NI73	299 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM77	I1YAP6	450 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GPR137B	O60478	399 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	STAM2	O75886	525 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MMP1	P03956	469 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TGFB3	P10600	412 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PDGFRA	P16234	1089 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MCC	P23508	829 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	CALML3	P27482	149 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	PRKCI	P41743	596 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TUBA1B	P68363	451 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	EGR4	Q05215	589 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SCN1B	Q07699	218 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ACSM1	Q08AH1	577 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	DLG1	Q12959	904 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	GPM6B	Q13491	265 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF234	Q14588	700 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	NFATC4	Q14934	902 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	ASIC2	Q16515	512 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	EPC2	Q52LR7	807 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		3.89	□□□□□ -1.79
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		3.89	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms