RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529895.1

BBS1-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 2

Gene BBS1, Length 560 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-216ENST00000529895 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PLD3Q8IV08 490 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MGARPQ8TDB4 240 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CMKLR1Q99788 373 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 IPPKQ9H8X2 491 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.64□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PPP6CO00743 305 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 OR7A17O14581 309 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 HAT1O14929 419 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 TRIM13O60858 407 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CTSBP07858 339 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SPINK2P20155 84 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 GABRA4P48169 554 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CLCQ05315 142 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CHIT1Q13231 466 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 DOC2AQ14183 400 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 NAA25Q14CX7 972 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 XKR6Q5GH73 641 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ATG9BQ674R7 924 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FAM129CQ86XR2 697 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 BMPERQ8N8U9 685 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MDM1Q8TC05 714 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PELI2Q9HAT8 420 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 WASF3Q9UPY6 502 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PTPRBP23467 1997 aa14.63□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 A0A0J9YVX5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 A0A1B0GTL3 188 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FEZF1A0PJY2 475 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 KATNA1O75449 491 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 WFS1O76024 890 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ITIH1P19827 911 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CD22P20273 847 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ETV5P41161 510 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CASP2P42575 452 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PIK3CGP48736 1102 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 MC2RQ01718 297 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 IRF8Q02556 426 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FOXM1Q08050 763 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PCDH1Q08174 1060 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 GPR19Q15760 415 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CFAP157Q5JU67 520 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 HHATQ5VTY9 493 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 RNF44Q7L0R7 432 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 WDR34Q96EX3 536 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CDK15Q96Q40 435 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 OR6C1Q96RD1 312 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 KLK13Q9UKR3 277 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 SATB2Q9UPW6 733 aa14.62□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 B4E171 279 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PLD2O14939 933 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 BIRC5O15392 142 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 TSPAN7P41732 249 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CCR10P46092 362 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 CCNG1P51959 295 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 PPP2R2AP63151 447 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 REEP5Q00765 189 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 ACY1Q03154 408 aa14.61□□□□□ -0.07
BBS1-216ENST00000529895 RELAQ04206 551 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms