RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 PHKG1Q16816 387 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 STEAP4Q687X5 459 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 NACC2Q96BF6 587 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CABS1Q96KC9 395 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 H7BY64 318 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ITGA8P53708 1063 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 EMP3P54852 163 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 TBPL1P62380 186 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 RELAQ04206 551 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 KLC1Q07866 573 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 VWA2Q5GFL6 755 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCK2Q7Z695 626 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 GALNT7Q86SF2 657 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 HPS6Q86YV9 775 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PDIK1LQ8N165 341 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 AMER3Q8N944 861 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 LINGO1Q96FE5 620 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 OLFM1Q99784 485 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CRB3Q9BUF7 120 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 C5AR2Q9P296 337 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXS1O43638 330 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 Q0VFX4 171 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ATCAYQ86WG3 371 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SHISA5Q8N114 240 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 C8GP07360 202 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 GNLYP22749 145 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 DSG2Q14126 1118 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 RBBP7Q16576 425 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 HIF1AQ16665 826 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 IGFL3Q6UXB1 125 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 GPATCH11Q8N954 259 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 MIEF2Q96C03 454 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 C8orf44Q96CB5 159 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC138Q96M89 665 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PARVBQ9HBI1 364 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 C3orf18Q9UK00 162 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PSAT1Q9Y617 370 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-204ENST00000528201 FDXRP22570 491 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ITGA3P26006 1051 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC26A3P40879 764 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 RGS4P49798 205 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 EFNA3P52797 238 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 OCA2Q04671 838 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SP140Q13342 867 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 NAE1Q13564 534 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SYT16Q17RD7 645 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC16A5O15375 505 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 ALPPP05187 535 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-204ENST00000528201 CSNK1G2P78368 415 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms