RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517005.1

RN7SKP233-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 233, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP233, Length 110 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP233-201ENST00000517005 NRBF2Q96F24 287 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 OR2M4Q96R27 311 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CDC6Q99741 560 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 BOCQ9BWV1 1114 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TRIM54Q9BYV2 358 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ASB8Q9H765 288 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 IGSF5Q9NSI5 407 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 FAIMQ9NVQ4 179 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SMOXQ9NWM0 555 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TOR4AQ9NXH8 423 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 FTSJ1Q9UET6 329 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 DOLKQ9UPQ8 538 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 BPTFQ12830 3046 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 A8MT66 165 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 FBP2O00757 339 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TNFSF14O43557 240 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 AKAP10O43572 662 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 VEGFDO43915 354 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 DNAJB5O75953 348 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 RASAL1O95294 804 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ALPPL2P10696 532 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 IDO1P14902 403 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CKMT2P17540 419 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 LBPP18428 481 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ITGALP20701 1170 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GABRB3P28472 473 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SLC1A2P43004 574 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 MAGEA8P43361 318 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 EMP3P54852 163 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 HERVK_113P63132 956 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ACVR1Q04771 509 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CACNG1Q06432 222 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 MERTKQ12866 999 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 NRF1Q16656 503 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PROX2Q3B8N5 592 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TBCELQ5QJ74 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CNSTQ6PJW8 725 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 Q6ZNX1 250 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SPRED1Q7Z699 444 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GPR180Q86V85 440 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PROSER1Q86XN7 944 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GKN2Q86XP6 184 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CEP97Q8IW35 865 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 NXPE1Q8N323 547 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SMYD1Q8NB12 490 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 TRPV3Q8NET8 790 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 HDAC10Q969S8 669 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 C19orf60Q96EN9 201 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 MAGED4Q96JG8 741 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 APOLD1Q96LR9 279 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 RDH12Q96NR8 316 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 DOK1Q99704 481 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 OCEL1Q9H607 264 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 RMI1Q9H9A7 625 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 GPR34Q9UPC5 381 aa6.99□□□□□ -1.29
RN7SKP233-201ENST00000517005 KCNK6Q9Y257 313 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms