RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C4orf45Q96LM5 186 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IMMP1LQ96LU5 166 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM20AQ96MK3 541 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BTBD10Q9BSF8 475 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PI4K2AQ9BTU6 479 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAXXQ9BUH6 204 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q9N2K0 584 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NECAP2Q9NVZ3 263 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NID2Q14112 1375 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCL24O00175 119 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SAP18O00422 153 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR10H2O60403 315 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RHBDL1O75783 438 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR6B1O95007 311 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACSL3O95573 720 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 APBB3O95704 486 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BAG3O95817 575 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GH2P01242 217 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HCKP08631 526 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADORA3P0DMS8 318 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TOP1P11387 765 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GDF1P27539 372 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALDH1B1P30837 517 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC6A6P31641 620 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GABRA5P31644 462 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HMGCLP35914 325 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PBX3P40426 434 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC1A4P43007 532 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PFN3P60673 137 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERVK-16P61578 105 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UBE3AQ05086 875 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TGIF1Q15583 401 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DLG2Q15700 870 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGCBQ16585 318 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCL14Q16627 93 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf228Q6PIY5 440 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRD3OSQ6XYD6 125 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF600Q6ZNG1 722 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF175Q8N4F7 328 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VPS37AQ8NEZ2 397 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GANCQ8TET4 914 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C11orf52Q96A22 123 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ELMOD3Q96FG2 381 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR63Q9BZJ6 419 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCSER1Q9C0I3 900 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FZD8Q9H461 694 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EGLN3Q9H6Z9 239 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TLE6Q9H808 572 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAJC18Q9H819 358 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SETD4Q9NVD3 440 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WIF1Q9Y5W5 379 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AUP1Q9Y679 476 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SORL1Q92673 2214 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP23Q9P227 1491 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PRG0 241 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FRG2CA6NGY1 282 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 B4DXG7 233 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 F8VVB4 439 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 F8VWA3 439 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TSPAN4O14817 238 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SSX4O60224 188 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TOXO94900 526 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGLV3-19P01714 112 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP1B1P05026 303 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV4-1P06312 121 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GP1BBP13224 206 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD1DP15813 335 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD27P26842 260 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GNALP38405 381 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL34P49207 117 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HARS2P49590 506 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EFNA3P52797 238 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HMGCS2P54868 508 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYL7Q01449 175 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CA9Q16790 459 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WSCD2Q2TBF2 565 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UGT3A2Q3SY77 523 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ELFN2Q5R3F8 820 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4C11Q6IEV9 310 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms