RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 POLLQ9UGP5 575 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KIAA0355O15063 1070 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DCLK1O15075 740 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ADORA3P0DMS8 318 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CHRNA5P30532 468 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TNFSF8P32971 234 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BMP8BP34820 402 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SOX10P56693 466 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RBP5P82980 135 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RGS1Q08116 209 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GRB7Q14451 532 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BTBD16Q32M84 506 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GPR149Q86SP6 731 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SP8Q8IXZ3 490 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 UBA3Q8TBC4 463 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ARMC5Q96C12 935 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HPF1Q9NWY4 346 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.59□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 B4DXG7 233 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 WRBO00258 174 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RFPL3O75679 317 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ANXA9O76027 345 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GDF11O95390 407 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CDK1P06493 297 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 FABP1P07148 127 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NFICP08651 508 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ANXA8P13928 327 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CPT1AP50416 773 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GBX1Q14549 363 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 XKR7Q5GH72 579 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CLLU1Q5K131 121 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MPP7Q5T2T1 576 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 TRIM69Q86WT6 500 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NIM1KQ8IY84 436 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SLC43A2Q8N370 569 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR2T12Q8NG77 320 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR7G3Q8NG95 312 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SRRQ9GZT4 340 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PXMP2Q9NR77 195 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BTG4Q9NY30 223 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 PKP3Q9Y446 797 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MSCO60682 206 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HCN1O60741 890 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 EPOP01588 193 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 KELP23276 732 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ACTR1BP42025 376 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 FNTBP49356 437 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SEC13P55735 322 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 HYAL2Q12891 473 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SLAMF1Q13291 335 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL12Q53G59 568 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ARL14Q8N4G2 192 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NXPE2Q96DL1 559 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF583Q96ND8 569 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 SERPINB11Q96P15 392 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.58□□□□□ -1.04
GPBP1-208ENST00000514387 COPS4Q9BT78 406 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms