RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503407.5

ACSL1-203, Transcript of acyl-CoA synthetase long chain family member 1, human

TSL 2

Gene ACSL1, Length 2,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSL1-203	ENST00000503407	ZNF682	O95780	498 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GGT2	P36268	569 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	CLCN3	P51790	818 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	NUDT6	P53370	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	TEK	Q02763	1124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	BAMBI	Q13145	260 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RIN1	Q13671	783 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	VEPH1	Q14D04	833 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	NR6A1	Q15406	480 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GTDC1	Q4AE62	458 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	TEX261	Q6UWH6	196 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	PPTC7	Q8NI37	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GPR137	Q96N19	417 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407		U3KQ87	197 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GABRD	O14764	452 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	FABP3	P05413	133 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RAB25	P57735	213 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RUNX1T1	Q06455	604 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GRB14	Q14449	540 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	LRRC66	Q68CR7	880 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	GPR152	Q8TDT2	470 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	TESC	Q96BS2	214 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	DUSP16	Q9BY84	665 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	DERL2	Q9GZP9	239 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACSL1-203	ENST00000503407	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	MYL12B	O14950	172 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	PROM1	O43490	865 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	MAFK	O60675	156 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	CCNDBP1	O95273	360 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	IFNA16	P05015	189 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	FH	P07954	510 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	SLC2A3	P11169	496 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	MYL12A	P19105	171 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	WEE1	P30291	646 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	HMGCL	P35914	325 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	HTR6	P50406	440 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	RHAG	Q02094	409 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	KCNC3	Q14003	757 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	MED22	Q15528	200 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	SSX1	Q16384	188 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	AANAT	Q16613	207 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	CCL15	Q16663	113 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	SHE	Q5VZ18	495 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	KDELC1	Q6UW63	502 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	ZNF605	Q86T29	641 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACSL1-203	ENST00000503407	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69

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