RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 MC5RP33032 325 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 SOX3P41225 446 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 DNA2P51530 1060 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 ALDH3A2P51648 485 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 MYL7Q01449 175 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 CDH18Q13634 790 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 ITGA7Q13683 1181 aa3.36□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.36□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 ATL1Q8WXF7 558 aa3.36□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 NYXQ9GZU5 481 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 CHKBQ9Y259 395 aa3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 ARID2Q68CP9 1835 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 A0A1W2PPM1 405 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 O00370 1275 aa3.35□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 TIMM44O43615 452 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 PLOD3O60568 738 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 MYBL1P10243 752 aa3.35□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 PEX6Q13608 980 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 TAB1Q15750 504 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 IQCHQ86VS3 1027 aa3.35□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC191Q8NCU4 936 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 THEGLP0DJG4 465 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 CD27P26842 260 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 PDHA2P29803 388 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 PPP5CP53041 499 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 LIMK2P53671 638 aa3.34□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 OR4A47Q6IF82 309 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.34□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.34□□□□□ -1.87
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UBE2B-203ENST00000503080 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 SERINC2Q96SA4 455 aa3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
UBE2B-203ENST00000503080 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.34□□□□□ -1.87
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