RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXM1Q08050 763 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF130Q86XS8 419 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SETD9Q8NE22 299 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RDM1Q8NG50 284 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NELL1Q92832 810 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDFY2Q96P53 400 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR18Q9BV38 432 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIGUQ9H490 435 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RICTORQ6R327 1708 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPTX1A8MV57 137 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 H3BM21 787 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BPNT1O95861 308 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF806P0C7X5 589 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGFBP5P24593 272 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACADLP28330 430 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNJ5P48544 419 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCAR1P56945 870 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSC2Q02487 901 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGALS3BPQ08380 585 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGL1Q08830 312 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2T4Q8NH00 348 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR152Q8TDT2 470 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FCGR1BQ92637 280 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB7BQ96AH8 199 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5M11Q96RB7 305 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNH6Q9H252 994 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR51M1Q9H341 326 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABCB9Q9NP78 766 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL1A2P08123 1366 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTS4O75173 837 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PGK1P00558 417 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1RP00736 705 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLBP06746 335 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGF2P09038 288 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RD3LP0DJH9 198 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLK1P53350 603 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HUNKP57058 714 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACY1Q03154 408 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF284Q2VY69 593 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFX4Q33E94 735 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MIER2Q8N344 545 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 POF1BQ8WVV4 589 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCEAL3Q969E4 200 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPSB2Q99619 263 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED18Q9BUE0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SARGQ9BW04 601 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLE3Q9NRF9 147 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF222Q9UK12 451 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms