RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	VAT1	Q99536	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	QSOX1	O00391	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AURKA	O14965	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GSTA4	O15217	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A9	O60656	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	JRK	O75564	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ANXA9	O76027	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PROSC	O94903	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LCA5L	O95447	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CRTAM	O95727	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MLYCD	O95822	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GSN	P06396	782 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TPM3	P06753	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TPM1	P09493	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A6	P19224	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A1	P22309	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A4	P22310	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KDELR1	P24390	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CD151	P48509	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARSE	P51690	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NEK2	P51955	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CTSC	P53634	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GEM	P55040	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WNT3A	P56704	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SOX8	P57073	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AP2B1	P63010	937 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DYNLT1	P63172	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZBED6	P86452	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RPA4	Q13156	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MPP3	Q13368	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ART3	Q13508	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IHH	Q14623	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MESD	Q14696	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	INA	Q16352	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	P3H4	Q92791	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	EID2B	Q96D98	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	COPS8	Q99627	209 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LHPP	Q9H008	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ASB8	Q9H765	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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