RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 OR52N5Q8NH56 324 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SLAMF9Q96A28 289 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 PTERQ96BW5 349 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 CHMP4AQ9BY43 222 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 PDE7BQ9NP56 450 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.45□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SZT2Q5T011 3432 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 HFM1A2PYH4 1435 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 COL24A1Q17RW2 1714 aa3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 MPZP25189 248 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 HNF4AP41235 474 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF75DP51815 510 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SNAPC1Q16533 368 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 CA9Q16790 459 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 CBWD6Q4V339 395 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SYT14P1Q58G82 188 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 CBWD3Q5JTY5 395 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 DHX58Q96C10 678 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 NXNL1Q96CM4 212 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 TMCO6Q96DC7 493 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SPDL1Q96EA4 605 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SFXN2Q96NB2 322 aa3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 THAP2Q9H0W7 228 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 CPVLQ9H3G5 476 aa3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 STUB1Q9UNE7 303 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 RIMS2Q9UQ26 1411 aa3.44□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 SPINK14Q6IE38 97 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 LYG1Q8N1E2 194 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF519Q8TB69 540 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.43□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 PADI2Q9Y2J8 665 aa3.43□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 SSH2Q76I76 1423 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGEF10O15013 1369 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 GLOD5A6NK44 160 aa3.42□□□□□ -1.86
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RABGGTB-206ENST00000467748 ACTN2P35609 894 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 HSPB3Q12988 150 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 PRKG2Q13237 762 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 TNIP1Q15025 636 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 C2CD6Q53TS8 623 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 TCTE1Q5JU00 501 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.42□□□□□ -1.86
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