RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CMPK1P30085 196 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GDF5P43026 501 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS4P49798 205 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CSRP3P50461 194 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 IL2P60568 153 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TBPL1P62380 186 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CSNK1G2P78368 415 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4D1Q15615 310 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR135Q8IZ08 494 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PPM1NQ8N819 430 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR56A3Q8NH54 315 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ESAMQ96AP7 390 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PTERQ96BW5 349 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR22Q99680 433 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RBBP8Q99708 897 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NLNQ9BYT8 704 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 AICDAQ9GZX7 198 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CUTCQ9NTM9 273 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HYKKA2RU49 373 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DSCR3O14972 297 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ALOX12BO75342 701 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP9O95302 570 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ONECUT2O95948 504 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GALT4O96024 378 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTA2P09210 222 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM153BP0C7A2 387 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD1DP15813 335 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF9Q00978 393 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CAV1Q03135 178 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 NCF4Q15080 339 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT8Q16880 541 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT16Q17RD7 645 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM153CQ494X1 144 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GRTP1Q5TC63 336 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 BORAQ6PGQ7 559 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 LCTLQ6UWM7 567 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF18AQ8NI77 898 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL8Q96CD0 374 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MOCOSQ96EN8 888 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MED8Q96G25 268 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SPSB2Q99619 263 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CPNE1Q99829 537 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.68□□□□□ -1.34
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