RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 SERPINB8P50452 374 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CYP4F2P78329 520 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TGFBIQ15582 683 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 LGSNQ5TDP6 509 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1191Q96A73 305 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 FAM117AQ9C073 453 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 SNX15Q9NRS6 342 aa20.49■□□□□ 0.87
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ABCD4-202ENST00000460308 CD274Q9NZQ7 290 aa20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 DYRK1BQ9Y463 629 aa20.49■□□□□ 0.87
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ABCD4-202ENST00000460308 HMX2A2RU54 273 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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ABCD4-202ENST00000460308 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 C2P06681 752 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.48■□□□□ 0.87
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ABCD4-202ENST00000460308 CDH1P12830 882 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TFEBP19484 476 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CNTFP26441 200 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 PTPN4P29074 926 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 OR4D1Q15615 310 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 LCN10Q6JVE6 187 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 GBP5Q96PP8 586 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 NLNQ9BYT8 704 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ALG9Q9H6U8 611 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.48■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 A0A096LPK6 155 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1B0GX78 115 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 FITM1A5D6W6 292 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TXNDC9O14530 226 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 DSCR3O14972 297 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CREG1O75629 220 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 GMPRP36959 345 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CCR8P51685 355 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CSNK1G2P78368 415 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ERV3-1Q14264 604 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CDKL4Q5MAI5 379 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 MLIPQ5VWP3 458 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 KLC3Q6P597 504 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 PLD3Q8IV08 490 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 EXT2Q93063 718 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 PTERQ96BW5 349 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 NXNL1Q96CM4 212 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CABS1Q96KC9 395 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CATSPER2Q96P56 530 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 OR2A5Q96R48 311 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 OR4K3Q96R72 315 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 RUFY1Q96T51 708 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 VPS11Q9H270 941 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ACTL8Q9H568 366 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 WWOXQ9NZC7 414 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.47■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 WDR47O94967 919 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CD63P08962 238 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TNFRSF8P28908 595 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CDC20Q12834 499 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 DLG1Q12959 904 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 MUM1Q2TAK8 710 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 ISCA2Q86U28 154 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 THAP11Q96EK4 314 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC77Q9BR77 488 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.46■□□□□ 0.87
ABCD4-202ENST00000460308 FEZF1A0PJY2 475 aa20.45■□□□□ 0.86
ABCD4-202ENST00000460308 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.45■□□□□ 0.86
ABCD4-202ENST00000460308 KLHL2O95198 593 aa20.45■□□□□ 0.86
ABCD4-202ENST00000460308 RECKO95980 971 aa20.45■□□□□ 0.86
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