RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 NKG7Q16617 165 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 SPSB2Q99619 263 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 H7BY64 318 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 HAT1O14929 419 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 EMP3P54852 163 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 MUM1Q2TAK8 710 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 HKDC1Q2TB90 917 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 ADCK2Q7Z695 626 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 PLD3Q8IV08 490 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB3-202ENST00000460160 WISP1O95388 367 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TEX19Q8NA77 164 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CABS1Q96KC9 395 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 A6NL46 340 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PIAS1O75925 651 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 NAE1Q13564 534 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 DCAF10Q5QP82 559 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 NUDT9Q9BW91 350 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SGPP1Q9BX95 441 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PTPN13Q12923 2485 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PEX12O00623 359 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 P2RX6O15547 441 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 MMP11P24347 488 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CSRP3P50461 194 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 COL26A1Q96A83 441 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ARL15Q9NXU5 204 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HIST1H2ADP20671 130 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SAT1P21673 171 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HRH2P25021 359 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SSTR1P30872 391 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 AP1S2P56377 157 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF460Q14592 562 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 NACC2Q96BF6 587 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 GPR83Q9NYM4 423 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 MASP2O00187 686 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 IGHEP01854 428 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CCND1P24385 295 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TAS2R39P59534 338 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CSNK1G2P78368 415 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 RAPSNQ13702 412 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SBSNQ6UWP8 590 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 C17orf64Q86WR6 236 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 MVB12AQ96EY5 273 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 RHOJQ9H4E5 214 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CDC23Q9UJX2 597 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 AGPSO00116 658 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SOCS6O14544 535 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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