RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 WRNIP1Q96S55 665 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CGRRF1Q99675 332 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MIPEPQ99797 713 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MYOCQ99972 504 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RHOXF2Q9BQY4 288 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MXD3Q9BW11 206 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FOXP3Q9BZS1 431 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ELOVL4Q9GZR5 314 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 METTL7AQ9H8H3 244 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SIX2Q9NPC8 291 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CHST11Q9NPF2 352 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RNF146Q9NTX7 359 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FOXD4L1Q9NU39 408 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD10Q9NXR5 420 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 KIF17Q9P2E2 1029 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 STOML1Q9UBI4 398 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D29Q9UFV1 150 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CTNNA3Q9UI47 895 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GMEB2Q9UKD1 530 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 JRKLQ9Y4A0 524 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 WIPI2Q9Y4P8 454 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GJA3Q9Y6H8 435 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 VWA8A3KMH1 1905 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MYH7P12883 1935 aa-2.13□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 QSER1Q2KHR3 1735 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PTPRKQ15262 1439 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MYH3P11055 1940 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PPZ6 126 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SHTN1A0MZ66 631 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C4orf51C9J302 202 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRAC2D3DTV9 90 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 H0Y9J4 135 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 K7EM74 188 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 BMPR1BO00238 502 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 EML1O00423 815 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MLNRO43193 412 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGEF9O43307 516 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA0513O60268 411 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRMT3O60678 531 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 AVILO75366 819 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SCO1O75880 301 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RAD17O75943 681 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CELF2O95319 508 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF682O95780 498 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NUDT14O95848 222 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GLAP06280 429 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00271P0C7V0 271 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SNHG28P0DPA3 235 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 LBPP18428 481 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MX2P20592 715 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GPTP24298 496 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PSMB6P28072 239 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ADRA1AP35348 466 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GARSP41250 739 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RFX3P48380 749 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ASCL1P50553 236 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CTSCP53634 463 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 EMP2P54851 167 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CDH8P55286 799 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TIRAPP58753 221 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2D3P61077 147 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DCAF7P61962 342 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CSNK1G2P78368 415 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PSG6Q00889 435 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 BSPH1Q075Z2 132 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SNTA1Q13424 505 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GK3PQ14409 553 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MVPQ14764 893 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NR0B2Q15466 257 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MMDQ15546 238 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NKPD1Q17RQ9 610 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MICAQ29983 383 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HLA-DRB5Q30154 266 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms