RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 PRPS2P11908 318 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ENGP17813 658 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ATF6P18850 670 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NUDT6P53370 316 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KCNJ10P78508 379 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 FAM189BP81408 668 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ZXDBP98169 803 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ZNF45Q02386 682 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ELP6Q0PNE2 266 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 TWF1Q12792 350 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NFATC2Q13469 925 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 IRF3Q14653 427 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NDUFA5Q16718 116 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 AGAP6Q5VW22 663 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RBFAQ8N0V3 343 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ULK4Q96C45 1275 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 AGAP4Q96P64 663 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KCNC2Q96PR1 638 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RAD9AQ99638 391 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 TTPALQ9BTX7 342 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 REEP1Q9H902 201 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NEK6Q9HC98 313 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 AMBNQ9NP70 447 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RAD18Q9NS91 495 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GPR83Q9NYM4 423 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 VPS4AQ9UN37 437 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SNX6Q9UNH7 406 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 CLCA1A8K7I4 914 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 M0R129 80 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NBNO60934 754 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 CLDN11O75508 207 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 STK16O75716 305 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KRT6AP02538 564 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KRT6BP04259 564 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NUDT7P0C024 238 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 COL6A1P12109 1028 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 DGKAP23743 735 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ACRV1P26436 265 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KIR3DL1P43629 444 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KRT6CP48668 564 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ARHGDIAP52565 204 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 UGT2B15P54855 530 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 MACC1Q6ZN28 852 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 CCDC190Q86UF4 302 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 RNF175Q8N4F7 328 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 AMER2Q8N7J2 671 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ZNF675Q8TD23 568 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GGHQ92820 318 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SPATA17Q96L03 361 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 APOLD1Q96LR9 279 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 EBPLQ9BY08 206 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 IL26Q9NPH9 171 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.39□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 A0A1B0GVM2 712 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 KRT87PA6NCN2 255 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GFRA2O00451 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 FPGTO14772 594 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 AOC2O75106 756 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 EPN2O95208 641 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 GJB5O95377 273 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 DNTTP04053 509 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 STSP08842 583 aa6.38□□□□□ -1.39
RARB-204ENST00000458646 ACPPP15309 386 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms