RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A096LPK6 155 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 H0YGG7 62 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TXNDC9O14530 226 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NRP2O60462 931 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CD63P08962 238 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 MYBL2P10244 700 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPN4P29074 926 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEA12P43365 314 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CSNK1G2P78368 415 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 RHDQ02161 417 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 DLG1Q12959 904 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC29A2Q14542 456 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4D1Q15615 310 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ADCK2Q7Z695 626 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SARGQ9BW04 601 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NLNQ9BYT8 704 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 LAMA5O15230 3695 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SPTBP11277 2137 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 HYKKA2RU49 373 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN1P07384 714 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TFEBP19484 476 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A12P48065 614 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNC1P48547 511 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CCR8P51685 355 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 LCN10Q6JVE6 187 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRD1Q6QNK2 874 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PDPRQ8NCN5 879 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 STARD8Q92502 1023 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NXNL1Q96CM4 212 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CATSPER2Q96P56 530 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CUTCQ9NTM9 273 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF112Q9ULX5 631 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC16AO15027 2179 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GX78 115 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 HAT1O14929 419 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 DSCR3O14972 297 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NKX2-8O15522 239 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KERAO60938 352 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KATNA1O75449 491 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CREG1O75629 220 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL2O95198 593 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGB2P05107 769 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 COL6A2P12110 1019 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ALAS2P22557 587 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GRK3P35626 688 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ACAP2Q15057 778 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SYVN1Q86TM6 617 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 MTBPQ96DY7 904 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 WBP1Q96G27 269 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC77Q9BR77 488 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 ALG9Q9H6U8 611 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 STARD5Q9NSY2 213 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms