RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.13□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPAN11A1L157 253 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 IQCF5A8MTL0 148 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7ERQ8 282 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 INPP4BO15327 924 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRMT3O60678 531 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEC22BO75396 215 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIPRLO75663 272 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CATP04040 527 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANXA6P08133 673 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSD3B1P14060 373 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TYRP14679 529 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAX7P23759 505 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRPH2P23942 346 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSD3B2P26439 372 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLA-FP30511 346 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 GGT5P36269 586 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPINT3P49223 89 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 NR1H2P55055 460 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 UFM1P61960 85 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ESRRGP62508 458 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHEXP78562 749 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFHR1Q03591 330 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHRNB3Q05901 458 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELP6Q0PNE2 266 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABRQ12979 859 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTF2H3Q13889 308 aa6.12□□□□□ -1.43
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SHQ1P1-201ENST00000437111 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TLR1Q15399 786 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.12□□□□□ -1.43
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SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB119Q8N690 84 aa6.12□□□□□ -1.43
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TERB1Q8NA31 727 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRPV3Q8NET8 790 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2T11Q8NH01 316 aa6.12□□□□□ -1.43
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SHQ1P1-201ENST00000437111 HM13Q8TCT9 377 aa6.12□□□□□ -1.43
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SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELMO1Q92556 727 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLMNQ92990 594 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM159Q96B96 161 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 RDH12Q96NR8 316 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDK15Q96Q40 435 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 VPS35Q96QK1 796 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CGREF1Q99674 301 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 BOCQ9BWV1 1114 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 DKK3Q9UBP4 350 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL36AQ9UHA7 158 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.12□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERTM1A2A2V5 107 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC160A6NGH7 325 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 MANBAO00462 879 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP6CO00743 305 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLGNO14967 610 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 DKK1O94907 266 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCELO95171 688 aa6.11□□□□□ -1.43
SHQ1P1-201ENST00000437111 RASAL1O95294 804 aa6.11□□□□□ -1.43
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