RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEH1Q9H213 219 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RFXANKO14593 260 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFB5O43674 189 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 B3GALT4O96024 378 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C9P02748 559 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IRF1P10914 325 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC19A1P41440 591 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VMACQ2NL98 169 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF675Q8TD23 568 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CEP44Q9C0F1 390 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0U1RQS6 177 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PQY0 241 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GPR39O43194 453 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ATF6P18850 670 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CXCR2P25025 360 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KDELR2P33947 212 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RGS4P49798 205 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LIMK1P53667 647 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 UGT2B15P54855 530 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OR2B6P58173 313 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CAMK2BQ13554 666 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRRQ15256 657 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HOMEZQ8IX15 550 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3R3Q92569 461 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TESCQ96BS2 214 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 APOL5Q9BWW9 433 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ACPTQ9BZG2 426 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GKN1Q9NS71 199 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CLCA1A8K7I4 914 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CBX4O00257 560 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ACSL4O60488 711 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NBNO60934 754 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 AOC2O75106 756 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GUCY1B2O75343 617 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF15O94989 841 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PRPS2P11908 318 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HTR3AP46098 478 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CACNG1Q06432 222 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CBLL1Q75N03 491 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT10Q86SR1 603 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CASD1Q96PB1 797 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OR51E2Q9H255 320 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PPT2Q9UMR5 302 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.48□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VWA8A3KMH1 1905 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SCO2O43819 266 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TLL1O43897 1013 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VIPP01282 170 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RING1Q06587 406 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GPR153Q6NV75 609 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC190Q86UF4 302 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RAET1EQ8TD07 263 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GGHQ92820 318 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TSSK3Q96PN8 268 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RAD9AQ99638 391 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC32Q9BV29 185 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CIPCQ9C0C6 399 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SPASTQ9UBP0 616 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SSX4O60224 188 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DPM1O60762 260 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KRT6AP02538 564 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KRT6BP04259 564 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EPB42P16452 691 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms