RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NR3C1P04150 777 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 H2AFZP0C0S5 128 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FAM228BP0C875 321 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 GZMAP12544 262 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFB7P17568 137 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 CHSY1Q86X52 802 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 C18orf12Q96KH6 178 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SDCBP2Q9H190 292 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ISCUQ9H1K1 167 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 RASA4O43374 803 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 CETN1Q12798 172 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PSMD6Q15008 389 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 GRHL3Q8TE85 626 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CT55Q8WUE5 264 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FAR1Q8WVX9 515 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 NCSTNQ92542 709 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC45Q96CN5 670 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 HES6Q96HZ4 224 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SMR3AQ99954 134 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 APOOQ9BUR5 198 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CARD9Q9H257 536 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PDE7BQ9NP56 450 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SIX2Q9NPC8 291 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FGF21Q9NSA1 209 aa6.04□□□□□ -1.44
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